| 17.12.20162016-12-17 13:00:00 | 13:00 | 2. Bundesliga | 17. R | St. Pauli - VFL Bochum | -:- |
| 11.12.20162016-12-11 13:30:00 | 13:30 | 2. Bundesliga | 16. R | Greuther Fürth - St. Pauli | -:- |
| 2.12.20162016-12-2 18:30:00 | 18:30 | 2. Bundesliga | 15. R | St. Pauli - Kaiserslautern | 0:0 (0:0) |
| 26.11.20162016-11-26 13:00:00 | 13:00 | 2. Bundesliga | 14. R | FC Heidenheim - St. Pauli | 2:0 (1:0) |
| 20.11.20162016-11-20 13:30:00 | 13:30 | 2. Bundesliga | 13. R | St. Pauli - Fortuna Düsseldorf | 0:1 (0:1) |
| 7.11.20162016-11-7 20:15:00 | 20:15 | 2. Bundesliga | 12. R | Wuerzburger Kickers - St. Pauli | 1:0 (0:0) |
| 31.10.20162016-10-31 20:15:00 | 20:15 | 2. Bundesliga | 11. R | St. Pauli - 1. FC Nürnberg | 1:1 (1:1) |
| 25.10.20162016-10-25 20:45:00 | 20:45 | DFB Pokal | 2. R | St. Pauli - Hertha BSC | 0:2 (0:1) |
| 14.5.20162016-5-14 13:45:00 | 13:45 | 3. Liga | 38. R | Energie Cottbus - Mainz 05 II | 2:3 (0:0) |
| 7.5.20162016-5-7 13:30:00 | 13:30 | 3. Liga | 37. R | RW Erfurt - Energie Cottbus | 0:1 (0:1) |
| 30.4.20162016-4-30 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 36. R | Energie Cottbus - Wuerzburger Kickers | 1:2 (1:0) |
| 22.4.20162016-4-22 19:00:00 | 19:00 | 3. Liga | 35. R | VFB Stuttgart II - Energie Cottbus | 0:1 (0:1) |
| 16.4.20162016-4-16 14:10:00 | 14:10 | 3. Liga | 34. R | Energie Cottbus - Sonnenhof Großaspach | 0:5 (0:4) |
| 9.4.20162016-4-9 14:05:00 | 14:05 | 3. Liga | 33. R | Preußen Muenster - Energie Cottbus | 3:0 (1:0) |